Dona Dona berpusat di sekitar sebuah kafe kecil bernama sama, yang berlokasi di sebuah gang sempit di suatu sudut kota. Meskipun tampak seperti kafe biasa, Dona Dona memiliki keunikan yang menarik: kafe ini adalah pintu gerbang antara dunia nyata dan dunia roh. Di sini, para tamu dapat bertemu kembali dengan orang-orang yang telah meninggal dalam kehidupan mereka, menyatu kembali dengan kenanga…